SRA数据下载
SRA数据下载 0.简介 主要讲如何通过利用aspera快速下载sra数据。 1.数据搜寻 一般大多数还是习惯在NCBI上检索数据,比如我随便搜索一个拟南芥的SRA数据。 SRR627952: 但是一般下载还是在EBI上下,EBI和NCBI SRA号是通用的。EBI下载界面比NCBI人性化很多,(2
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LncRNA鉴定 0.简介 主要参考一篇NC文章鉴定lncRNA流程。 https://www.nature.com/articles/s41467-018-07500-7 1.质控 #!/bin/bash for i in `ls *.fastq`;do x=${i/.fastq/}; ech